随着中国改革开放几十年来经济的高速发展，国家经济体制的不断改善和现代企业制度的不断完善，现代企业在自身的经营方式和运行机制上都存在着极大的变革和进步。 下面是新时期国有企业内部控制面临的问题。
如果国内企业想要在这个环境下得以生存和发展，必须从改善自身开始做起，提高企业自身的竞争力。中国经济的最关键支柱就是国有企业，然而在经历了多年的发展之后已经出现了各种各样的问题，其中最为严重的就是国有企业的内部控制的问题。内部控制是企业在经济发展和成熟的进程中必须的产物，如果国有企业想要得到进一步的发展，必须从加强企业的内部控制开始做起。
国有企业内部控制存在的问题
1、国有企业内部控制环境差、基础薄弱。目前，我国国有企业国有股一股独大，制约着公司内部管理和外部治理机制作用的发挥。国有企业内部缺乏真正有动力的主体，其控制效率低，控制风险加大，此外，国有企业控股股东或领导人集控制权、行政权、监督权于一身的现象比较突出，治理结构存在着所有者监管缺位的致命缺陷。虽然绝大部分国有企业根据《公司法》等相关法律的要求建立了股东会、董事会和监事会等类似机构，但是，如今却有越拉越多的国有企业在选择继位者的时候都是又公司的总经理来兼任，这样只会导致经营者之间的职能重叠，造成企业高层管理者权利之间制衡机制的失效。作为一个专门的监督机构，监事会是隶属于股东会或者董事会的，但是监事会却经常会出现一个经济无法独立的问题，并且它们的部门成员一般和股东会与经营者之间都存在着各种密切的关系，很难实现对经营者的有效监督。从我国已曝光的国有企业财务舞弊案例来看，例如中核集团、中航油事件等，绝大多数都是由于这些国有企业领导人在企业内部权利过于集中，缺乏有效监督，内部控制环境薄弱造成的。
2、内部控制执行差，缺乏监督评价机制。从目前的情况来看，还有很多国有企业没有建立健全内部控制机构，同时有些企业已经建立内部机构多数处于被控对象的领导之下，独立性较差，不能充分发挥应有的作用，内控制度形同虚设。比如，有些企业缺乏对职工借款方面的内控制度，导致职工在借款事项完成后长期不报账，大量借款在个人手中得不到单位的监控，容易造成单位资金流失。还比如，有些企业内控制度规定“报销招待费需要有招待审批单并列明招待标准，支出汽油费要有派车单等手续”。可以说这个单位的内控制度规定很好，但在实际实施过程中，不执行的理由也很多，导致其内控制度缺乏实用性和有效性。
3、财务部门地位不高，会计基础工作较差。很多国有企业财务管理的薄弱，往往与经营者的观念有很大关系。许多企业经营者，不能说不重视财务。但往往认为财务管理就是会计核算，而对于财务管理作为企业经营管理的核心内控体系，到底管理些什么，作用是什么，认识比较模糊。领导的观念决定了财务部门的工作方向，因而许多企业的财务职能，就往往只剩下会计核算和出纳结算。一些企业会计基础工作较差，会计人员做账不规范，原始记录基础工作较差，有的甚至不能做到财务收支的日清月结，此外，资金使用随意性较大，财务核算、管理弱化，不能全面提供真实、完整、有效的财务数据及相关资料，造成了财产不实，家底不清，数据不准，信息无用，给企业内部管理带来消极影响。
4、制度观念薄弱，缺少风险意识。有些国有企业管理决策层制度观念薄弱，不愿意设立适当的控制或不能遵守控制制度，那么可以肯定其内部控制效果将大大降低，甚至失效。管理人员的管理风格对于企业内部控制的效率和效果影响深远，直接影响到企业员工的道德行为、思维方式和品行操守。另外很多国有企业缺乏风险意识，没有设立风险评估系统，这也影响了企业在内部控制上产生的效果和效率。很多面临困境和破产的企业，都有缺乏风险意识这个原因。这些企业在决策时，错在没有能够做出一些风险分析，更加不用说让他们在企业上建立起高级的风险预警系统了。很多企业出了问题，只会胡乱投资，胡乱贷款，胡乱担保和铺摊子，一旦出现了什么资金上的问题或者经营上的风险，便会把企业直接推向死路。